Yang pertama dari teknologi pengurutan throughput tinggi, pengurutan tanda tangan paralel besar-besaran (atau MPSS), dikembangkan pada 1990-an di Lynx Therapeutics, sebuah perusahaan yang didirikan pada 1992 oleh Sydney Brenner dan Sam Eletr. MPSS adalah operasi berbasis manik yang menggunakan complex di tangan ligasi adaptor diikuti dengan decoding adaptor, membaca penggabungan dalam penambahan empat nukleotida. Operasi ini membuatnya rentan terhadap bias urutan tertentu atau hilangnya urutan tertentu. Dengan alasan bahwa teknologinya begitu complex, MPSS hanya dilakukan 'in-house' oleh Lynx Therapeutics dan tidak DNA mesin sequencing dijual ke laboratorium independen. Lynx Therapeutics bergabung dengan Solexa (kemudian diakuisisi oleh Illumina) pada tahun 2004, yang mengarah pada pengembangan sequencing-by-synthesis, yang lebih sederhana diperoleh dari Manteia Predictive Medicine, yang menjadikan MPSS usang. Bagaimanapun, properti penting dari keluaran MPSS adalah tipikal dari tipe data throughput tinggi, termasuk ratusan ribu urutan pendek DNA. Dalam kasus MPSS, ini biasanya digunakan untuk sekuensing cDNA untuk pengukuran bentuk gen tingkat ekspresi.
Gambar 151A | Beberapa analisis penggabungan yang terfragmentasi harus dikumpulkan bersama berdasarkan area yang tumpang tindih. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) dari Wikimedia Commons
Penulis : Milos Pawlowski
Komentar
Posting Komentar