Prediksi struktur dan desain antibodi komputasi

Pentingnya antibodi dalam perawatan kesehatan dan industri bioteknologi menuntut pengetahuan tentang strukturnya dengan resolusi tinggi. Informasi ini digunakan untuk rekayasa protein, memodifikasi afinitas pengikatan antigen, dan mengidentifikasi epitop, dari antibodi tertentu. Kristalografi sinar-X adalah salah satu tindakan yang jelas digunakan untuk menentukan struktur antibodi. Meskipun demikian, mengkristalkan antibodi seringkali melelahkan dan memakan waktu. Pendekatan komputasi memberikan alternatif yang lebih murah dan lebih cepat untuk kristalografi, tetapi hasilnya lebih samar, karena tidak menghasilkan struktur empiris. Server web online seperti yang diilustrasikan oleh Pemodelan Antibodi Web (WAM) dan Prediksi Konstitusi Imunoglobulin (PIGS) memungkinkan pemodelan komputasi wilayah variabel antibodi. Antibodi Rosetta adalah antibodi baru F V server prediksi konstitusi wilayah, yang menggabungkan teknik canggih untuk meminimalkan loop CDR dan mengoptimalkan orientasi relatif rantai ringan dan berat, selain sebagai model homologi yang memprediksi keberhasilan pemasangan antibodi dengan antigen uniknya.

Gambar 396A | Mekanisme rekombinasi saklar kelas yang memungkinkan perpindahan isotipe dalam sel B yang diaktifkan | EN: Pengguna: Ciar / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Class_switch_recombination.png) dari Wikimedia Commons

Gambar 396A | Mekanisme rekombinasi saklar kelas yang memungkinkan perpindahan isotipe dalam sel B yang diaktifkan | EN: Pengguna: Ciar / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Class_switch_recombination.png) dari Wikimedia Commons

Penulis : Merim Kumars

Referensi:

Mikrobiologi Medis II: Sterilisasi, Diagnosis Laboratorium, dan Respon Imun

Diagnostik Molekuler dalam Mikrobiologi

Komentar