Dengan menggunakan obat-obatan tertentu, pembuatan profil ribosom dapat mengungkapkan daerah permulaan mRNA atau daerah pemanjangan. Daerah awal dapat dideteksi dengan menambahkan harringtonine atau lactidomycin untuk mencegah inisiasi lebih lanjut. Hal ini memungkinkan kodon awal mRNA di seluruh lisat sel untuk dianalisis, yang telah digunakan untuk menentukan urutan non-AUG yang memulai translasi. Daerah lain yang memanjang dapat dideteksi dengan menambahkan antibiotik seperti cycloheximide yang menghambat translokasi, chloramphenicol yang menghambat transfer peptida di dalam ribosom, atau cara non-obat seperti pembekuan termal. Metode pembekuan elongasi ini memungkinkan kinetika terjemahan dianalisis. Karena beberapa ribosom dapat menerjemahkan satu molekul mRNA untuk mempercepat aksi translasi, RiboSeq mendemonstrasikan daerah pengkode protein di dalam mRNA dan seberapa cepat hal ini dilakukan tergantung pada mRNA yang diurutkan. Selain itu, hal ini memungkinkan pembuatan profil ribosom untuk menampilkan situs jeda dalam transkriptom pada kodon tertentu. Situs terjemahan lambat atau jeda ini ditunjukkan oleh peningkatan kepadatan ribosom dan jeda ini dapat menghubungkan protein tertentu dengan perannya di dalam sel.
Gambar 251A | Ribosome Profil singkatnya | DennisPietras / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:RibosomeProfilejpg.jpg) from Wikimedia Commons
Penulis : Yavor Mendel
Komentar
Posting Komentar